田黄石的成因说法诸多，婆说婆理，公说公理。但有一点可以确定，就是最早起源于中生代火山喷发形成的基质，尔后又在地层中经过地下水二次浸润赋色成为田黄石的。其中有说田黄石是由风雨剥蚀的高山母矿脉中分离散落出来的零星矿石，后经溪水中滚动迁移，又长期埋于土层中赋色成为田黄石。fZz博雅艺术网

    疑问之一：从坑头溪的源头坑头占到寿山溪的下游结门潭，全长八公里，出产田黄石的土地仅为一平方公里。而且即便是“出产”田黄石的土地，也被分之为：上坂、中坂、下坂和碓下坂，四坂中所产的田黄也有较明显的区别，上坂田的田黄质灵色淡；中坂田的田黄质嫩色浓；下坂田的田黄质凝腻，作桐油色；碓下坂的田黄，质粗硬，色黝暗。“为什么同为从高山上滚入田中的母石，会在各坂的水田中有这么大的变化呢？至今我们还没有得到令人信服的答案。”（王敬之先生疑点）fZz博雅艺术网

    疑问之二：高山主峰是典型的死火山锥型山峰，经风雨剥蚀的零星散石应向四周分散滚落，为什么田黄石却只存在于高山东南面坑头溪及下游寿山溪流域的地层下面？“而同在高山之下，仅隔坑头溪数步之遥的大段溪却至今没有发现过田黄石”（王敬之先生疑点）fZz博雅艺术网

    疑问之三：这里王敬之先生给出来一个不太肯定的解释：“上坂田石浸润的是百分之一百的坑头溪水，这种水质中某种元素比较浓，所以被浸润的田石比较通透，颜色较淡；中坂田石浸润的是百分之五十的坑头溪水，此时水质的某种元素比较中和，所以被浸润的田石比较温润，颜色也比较饱满；下坂田石浸润的是百分之二十五的坑头溪水，此时水质中的某种元素已经较淡，对田石的作用减少，所以被浸润的田石比较凝腻，颜色也比较黝暗，当然各溪的水流量不尽相同，这里不过是个比喻。或许这样才能解释田黄石的成因及上、中、下坂田黄石的区别。”这种比喻似乎有一定的道理，但是，溪水中所含的某种元素究竟是什么？如果田石是因为被溪水浸润而赋色，是因为溪水中的某种元素的浓淡因素造成上、中、下、碓四坂所产的田黄石出现了明显的区别的话，那么，上坂田石浸润的是百分百的坑头溪水，其石色泽应该最饱满才对。而实际却是上坂田石的颜色反而较浅淡，石质较通透。下坂所产的田石才色最黝深，质更凝腻。除非溪水中的某种元素是具有洗净功能的，才可以得出这样的结论：由于上坂到下坂溪水里的某种元素逐渐减少，洗净的功能依次下降，才使得田石色泽逐渐加深的。那么，这又和田黄石的二次生赋色的结论相悖。显然，溪水本身是没有赋色功能的。